ICS 67.120 B 45 DB22 吉 林 省 地 方 标 准 DB 22/T 2260—2015 鹿鞭鉴定方法 PCR 法 Identification of Sika Deer and Wapiti Pizzles----Polymerase Chain Reaction Method 2015 - 02 - 01 发布 吉林省质量技术监督局 2015 - 03 - 01 实施 发 布 DB22/T 2260—2015 前 言 本标准按照GB/T 1.1-2009和GB/T 20001.4-2001给出的规则起草。 本标准由吉林省畜牧业管理局提出并归口。 本标准起草单位:中国农业科学院特产研究所。 本标准主要起草人:邢秀梅、吴琼、杨福合、苏伟林、邵元臣、查代明、荣敏、刘华淼、徐佳萍、 杨颖、涂剑锋、张铁涛。 I DB22/T 2260—2015 鹿鞭鉴定方法 PCR 法 1 范围 本标准规定了梅花鹿鞭、马鹿鞭(塔河马鹿除外)的 PCR 鉴定方法。 本标准适用于梅花鹿鞭、马鹿鞭(塔河马鹿除外)的真伪鉴定。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 WS/T 230-2002 临床诊断中聚合酶链反应(PCR)技术的应用 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 鹿鞭 pizzle 梅花鹿、马鹿的外生殖器,包括阴茎及睾丸。 4 原理 针对梅花鹿、马鹿线粒体DNA(mtDNA)的D-loop区特异性基因序列设计引物,应用聚合酶链反应(PCR) 技术扩增特异性DNA片段,根据是否扩增出特异性片段对鹿鞭进行鉴定。 5 试剂和材料 除非另有说明,所有的化学试剂均为分析纯。实验用水规格应符合GB/T 6882中二级水的规定。 5.1 引物 上游引物:5’-CAAAGCACGTGATATAACCTTATG-3’ 下游引物:5’-ATCTAGTGCTCGAATTAATGGTAC-3’ 5.2 5.2.1 5.2.2 5.2.3 试剂 氯化钠(NaCl),CAS 号 7647-14-5。 氯化镁( MgCl2·6H2O),CAS 号 7791-18-6。 氢氧化钠(NaOH),CAS 号 1310-73-2。 1 DB22/T 2260—2015 5.2.4 琼脂糖,CAS 号 9012-36-6。 5.2.5 三羟甲基氨基甲烷(Tris),CAS 号 77-86-1。 5.2.6 十二烷基磺酸钠(SDS),CAS 号 2386-53-0。 5.2.7 乙二胺四乙酸二钠盐(Na2EDTA),CAS 号 15708-41-5。 5.2.8 盐酸(HCl),CAS 号 7647-01-0。 5.2.9 三氯甲烷(氯仿),CAS 号 67-66-3。 5.2.10 冰乙酸,CAS 号 64-19-7。 5.2.11 无水乙醇,CAS 号 64-17-5。 5.2.12 Tris 饱和酚,CAS 号 108-95-2。 5.2.13 Triton X-100,CAS 号 9036-19-5。 5.2.14 75%乙醇。 5.2.15 酚﹕氯仿混合液(体积比 1﹕1):Tris 饱和酚、氯仿等体积混合,置于棕色瓶中,4℃保存。 5.2.16 dNTP 溶液(市售):含 dATP、dTTP、dCTP、dGTP,各 2.5 mmol/L。 5.2.17 10×PCR Buffer 缓冲液(不含氯化镁)(市售):100 mmol/L KCl,160 mmol/L (NH4)2SO4, 20 mmol/L MgSO4,200 mmol/L Tris-HCl (pH 8.8),1% TritonX-100,1 mg/mL BSA。 5.2.18 Taq DNA 聚合酶(5 U/µL)。 5.2.19 溴化乙锭(10 mg/ml ):称量 100 mg 溴化乙锭溶解于 10 mL 水中,然后分装成 1 mL/份,4 ℃ 避光保存。 5.2.20 10 mM Tris:称量 24.22 g Tris 溶于 160 ml 蒸馏水中,加浓 HCL 调 pH 至 8.0,最后定容至 200 mL,常温保存。 5.2.21 0.5 mol/l EDTA:称量 186.1 g EDTA 溶于 800 mL 蒸馏水中,加 NaOH 调 pH 至 8.0,最后定容 至 1000mL,高压灭菌后,常温保存。 5.2.22 10% SDS:称量 10.0 g SDS 溶于 100 mL 蒸馏水中,55 ℃水浴锅中助溶。 5.2.23 20 mg/mL 蛋白酶 K:称量 100.0 mg 蛋白酶 K 溶于 5 ml 无菌去离子水(ddH2O)中,分装成 1 mL/ 份,-20 ℃保存。 5.2.24 50×TAE:称量 242.0 g Tris 溶于 700 mL 蒸馏水中,加入 57.1 mL 冰乙酸,100 mL 0.5 mol/L EDTA(pH8.0)后定容至 1000 mL,使用时 50 倍稀释。 5.2.25 细胞裂解液:0.5 % SDS,0.5 % Triton X-100,10 mM Tris pH 7.6,10 mM Na2EDTA,8 mM MgCl2, 8mM NaCl。 5.2.26 DNA 分子量标准:DL 2000。 5.2.27 6×loading Buffer(市售):含 0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青 FF,30%甘油水溶液,4 ℃保 存。 6 仪器 6.1 6.2 6.3 6.4 6.5 6.6 6.7 6.8 2 PCR 仪。 紫外分光光度计。 电泳仪。 凝胶成像系统。 离心机:离心力≥12000 g。 微量可调移液器:0.2 μL~2 μL,2 μL~20 μL,20 μL~200 μL,100 μL~1000 μL。 涡旋振荡器。 电子天平:感量 0.0001 g DB22/T 2260—2015 6.9 7 恒温水浴锅。 试样制备 新鲜、烘干或加工后鹿鞭样品,每个样品采集阴茎前段、中段及睾丸各选取2个点,每个点采集0.5 cm 的样品,在液氮下研磨成粉末状,放入冻存管中,-80 ℃保存。 3 8 8.1 分析步骤 提取 DNA 8.1.1 取处理后的试样约 50 mg,放入 1.5 mL 离心管中,加入 500 μL 细胞裂解液(5.2.25)摇匀, 加入 10 μL 蛋白酶 K,充分混匀后放入 55 ℃水浴中温和振荡,消化过夜。 8.1.2 加入等体积的 Tris 饱和酚,颠倒混匀离心,上清液转入新的离心管中,重复 2 次。 8.1.3 上清液加入等体积的酚和氯仿的混合液(1﹕1),缓慢混匀 10 min,4 ℃ 12000 r/min 离心 5 min, 吸取上清。 8.1.4 上清液中加入等体积的氯仿,颠倒混匀,4 ℃ 12000 r/min 离心 5 min,吸取上清。 8.1.5 加入 2 倍体积的冰乙醇,混匀,4 ℃ 12000 r/min 离心 10 min,弃上清液。 8.1.6 加入 75%乙醇 500 μL,4 ℃ 12000 r/min 离心 10 min,弃上清,沉淀核酸。 8.1.7 在 65 ℃烘箱中干燥 5 min; 8.1.8 加入 100 μL 超纯水,溶解,-20 ℃保存。 注:也可用DNA提取试剂盒提取,按照试剂盒操作说明书指示进行操作。 8.2 PCR 检测 8.2.1 PCR 反应体系 PCR反应体系见表1,同时设置阴性对照(无菌水)。 表1 PCR 反应体系 成分 用量/(μL) 10 × Buffer 2.5 dNTP/(2.5 mM) 3.0 上游引物/(10 μM) 0.5 下游引物/(10 μM) 0.5 Taq 酶/(5 U/μL) 0.5 DNA 模板 1.5 ddH2O 16.5 注:按照上述试剂顺序逐项加样至0.2 mL的PCR反应管中,混匀后瞬离。 8.2.2 PCR 反应程序 预变性95 °C,10 min;循环扩增94 ℃,1 min,56 ℃,50 s,72 ℃,1 min,30个循环;延伸72 ℃, 10 min。4 ℃保存。 3 DB22/T 2260—2015 8.2.3 扩增产物电泳 用1×TAE电泳缓冲液配制成1%琼脂糖平板(溴化乙锭终浓度0.5 μg/mL)。将平板放入水平电泳槽 中,加入1×TAE电泳缓冲液刚刚高出凝胶表面,将PCR扩增产物6 μL与1 μL上样缓冲液混合,分别加入 样品孔中,取5 μL DNA Marker DL 2000加入到标准分子量对照孔内。5 V/cm恒压电泳30 min-45 min。 凝胶成像系统下观察并分析。 9 结果判定 若待检样品出现306 bp或307 bp特异性片段,即判定为梅花鹿或马鹿鹿鞭。 必要时取PCR扩增产物进行测序,如果结果与附录A参考序列比较,序列相似性在95 %以上,可进一 步确认待测样品结果为阳性。 10 废弃物处理和防止污染的措施 10.1 检测过程中的废弃物需经 121 ℃高压灭菌处理至少 30 min。 10.2 检测过程中防止交叉污染的措施见 WS/T 230-2002 中第六章规定执行污染的预防和控制规定。 4 DB22/T 2260—2015 AA 附 录 A (资料性附录) 梅花鹿、马鹿的特征性序列 A.1 梅花鹿特异扩增片段序列(307bp) : ACAAAGCACGTGATATAACCTTATGTGTTTGTAGTACATAAAATTAATGCATTAAGGCACACATG TACAATGGTACATAAAATCGGTGTATAGGACATATTATGCATAATAGTACATAAATTAATGTATT AGGACATACTATGTATAATAGTACATTATATTATATGCCCCATGCTTATAAGCATGTATTTTCTAT TATCTACAGTACATAGTACATGATGTTGCTTATCGTACATAGCGCATTGAGTCAAATCAGTCCTC GTCAGCATGCGTATCCCGTCCACTAGATCACGAGCTTGATCACCATG A.2 马鹿特异扩增片段序列(306bp): GCAAAACACGTGATATAACCTTATGCGCTTGTAGTACATAAAATCAATGTACTAGGACATGCATG TATAACAGTACATAAGTTAGCGTATAGGACATATTATG
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